# メディパルホールディングス（7459） FY2025 有価証券報告書

Source: Komori (komori.app) — https://komori.app/company/7459/filing/2025-fy
提出日: 2026-06-23
対象期間: 2025-04-01 〜 2026-03-31
企業ページ: https://komori.app/company/7459
原本（EDINET）: https://disclosure2dl.edinet-fsa.go.jp/searchdocument/pdf/S100YI1C.pdf

## 要点

本書類（有価証券報告書）では、当連結会計年度に売上高・経常利益等が前年から増加しつつ、営業利益は減少したことや、医薬品物流の拠点稼働・品質向上、研究開発の実施などの取り組みが報告されています。加えて、MPアグロによるシグニホールディングス等の完全子会社化や、PALTACの完全子会社化に向けた公開買付けの決議（後発事象）も記載されています。

## 事業

本報告書は、株式会社メディパルホールディングスを中核とする医薬品・化粧品・日用品の卸売・関連事業を展開する企業グループの事業内容・体制・戦略を、複数年度の開示情報と照合可能な形で網羅的に抽出したものです。事業は「医療用医薬品等卸売事業」「化粧品・日用品、一般用医薬品卸売事業」「動物用医薬品・食品加工原材料卸売等関連事業」の三つの報告セグメントで構成され、グループは32社の子会社と19社の関連会社から成り、医薬品・化粧品・日用品・動物用医薬品等の販売やサービス提供を主たる事業としています。海外展開・デジタル基盤の強化・物流プラットフォームの高度化・地域医療への価値共創といった成長戦略を中期ビジョンとして掲げ、サステナビリティ推進と人材戦略を軸に、事業ポートフォリオのシフトとパートナーとの協働を推進しています。2027年3月期を最終年度とする「2027 メディパル中期ビジョン Change the 卸 Forever～たゆまぬ変革を～」を策定済みです。医薬分野では、地域医療コーディネート活動、物流機能の高度化、GD Pガイドラインに沿った品質管理、薬価制度の影響への対応、取引慣行の改善などを優先課題としています。サステナビリティ面では、マテリアリティとして6項目を特定し、KPIの設定と進捗管理を行っています。

## 数字

- 研究開発費: 15億円
- 設備投資: 99億円
- フリーキャッシュフロー: 559億円
- 従業員数: 13,024人

## セグメント

- 医療用医薬品等卸売事業 / 売上高 2.5兆円 / 営業利益 243億円
- 化粧品・日用品、一般用医薬品卸売事業 / 売上高 1.2兆円 / 営業利益 264億円
- 動物用医薬品・食品加工原材料卸売等関連事業 / 売上高 1,173億円 / 営業利益 23億円

## 前回からの変化

### サプライチェーン

本提出書類で、ISO 9001認証（GDP準拠の品質管理文脈含む）、東京ALC稼働（2026年1月）、MPタウタクのRDC滋賀建設、JCRファーマとのJ-Brain Cargo実施許諾契約が新規に確認できたため、関連エントリを追加し、既存のGDPガイドライン/医薬品医療機器等法/医療材料DB物品マスター/ALC全国拠点網へ言及追記を行った。

- + ISO9001認証（ALC9か所）
- + 東京ALC稼働2026
- + RDC滋賀建設
- + JCR実施許諾（J-Brain）

### 戦略的賭け

最新提出書類（2026-06-23）では、東京ALC稼働による物流拠点拡張、AI・ロボット技術を用いた物流自動化研究開発、物流DX・基幹システム改修による生産性向上、MEDIPAL Innovation投資事業組合を通じたベンチャー投資が再言及された。また、MPアグロによるシグニホールディングス取得（2026年1月）と、PALTACの完全子会社化に向けた公開買付け実施予定（後発事象）が新たに確認された。

- + MPアグロによるシグニ取得
- + PALTAC完全子会社化TOB

### 外部エクスポージャー

提出書類（2026-06-23）において、薬価・薬事規制・GDP準拠・為替リスクヘッジ・原材料/エネルギー価格変動・人口動態変化・気候/自然災害BCP・情報セキュリティ・労働力不足の各外部リスクが再言及された。加えて、JCRファーマ株式会社との海外実施許諾契約が明示され、新規の外部提携依存（外部エクスポージャー）として追加した。

- + JCRファーマ実施許諾契約

### 製品

本書類では、医療用医薬品等卸売事業・化粧品・一般用医薬品卸売事業・動物用医薬品等関連卸売事業はいずれも継続して記載された。加えて、物流機能の高度化として東京ALCの稼働（14か所目のALCを含む複合型センター拡張）が明記され、物流・流通・情報提供サービスの拡張が裏付けられた。新規に希少疾患治療薬候補の「JR-479」および検査サービス「LOX-index検査」「Flora Scan検査」が emerging_products として追加記載され、予防・検査領域の製品ラインが拡大した。

- + JR-479（GM2ガングリオシドーシス）
- + LOX-index検査
- + Flora Scan検査

### 技術

本提出書類では、物流DXに関する既存エントリ（AI・ロボットによる物流機能高度化、物流基幹システム統合とERP整備、高機能物流センターALC/FLC運用基盤、医薬品物流のGDP準拠手順、情報セキュリティ・BCP・データ保護）への言及があり、加えてISO9001認証取得、およびJ-Brain Cargo適用物質に関する実施許諾契約が新規で具体化されたため新規エントリを追加した。

- + ISO9001認証取得（ALC9か所）
- + J-Brain Cargo実施許諾契約

### 資本配分

提出書類（2026-06-23）では、(1) 物流拠点として東京ALC拡張・稼働開始、(2) MPタウタクのRD C滋賀建設、(3) R&D重点領域（希少疾患治療薬、腸内環境・炎症マーカー、LAB標準化材、Flora Scan検査精度等）、(4) 販売・物流基幹システム改修の投資、(5) 自己株式取得・配当、(6) 当座貸越枠、(7) シグニホールディングスの取得完了（既存エントリ完了化）、(8) PALTACの公開買付け決議（新規）などが確認できたため、既存エントリの追記と新規エントリ追加を行う。

- + 東京ALC拡張と稼働開始
- + RD C滋賀建設の設備投資
- + 希少疾患治療薬研究開発重点
- + LAB標準化材の研究開発重点
- + PALTAC完全子会社化の公開買付け
- − SigNi Holdingsの取得契約締結
- − SigNi Holdingsの取得契約締結

### ケイパビリティ構築

提出書類（2026-06-23）では、MPアグロによるシグニホールディングス取得（2026年1月）と、PALTACの完全子会社化に向けたTOB決議（2026年5月11日）に加え、物流機能高度化（東京ALC稼働）、AI・ロボットによる自動化研究開発、データ活用による販促高度化、GDP準拠品質管理、ALC9か所でのISO9001認証、単一ライン依存の脱却とバックアップ体制などの能力構築が新たに明示された。また既存の「人材評価制度」「ダイバーシティ推進（女性管理職目標含む）」「コンプライアンス統括室」「JCRファーマ実施許諾」に対しても言及がある。

- + MPアグロのシグニHD取得
- + PALTAC完全子会社化TOB
- + 物流機能高度化と東京ALC
- + AI・ロボット倉庫自動化
- + データ活用による販促高度化
- + GDPガイドライン品質管理
- + ALC9か所のISO9001認証
- + 単一ライン依存の脱却
- + MEDIPAL Innovation投資事業組合
- + IFRS16適用に向けたリース対応

### 規制ポジショニング

提出書類（2026-06-23）により、IFRS16リース基準の適用開始予定（2028年3月期期首）が新たに明示されるとともに、薬価制度・薬事規制対応、GDPガイドライン準拠の物流品質管理、サステナビリティ方針・マテリアリティ、脱炭素・女性活躍・男性育児休業目標、コンプライアンス体制、指名・報酬委員会、監査役会の体制、ISO9001認証取得の記載が当該正準エントリへ再言及された。

- + IFRS16リース基準の適用開始

## 会社自身の言葉

### 資本業務提携・子会社化（公開買付け/取得）

- 「PALTACを完全子会社化する目的の公開買付け実施を決議（2026年5月11日取締役会）。対象株式買付期間は2026年5月12日～7月7日、買付代金192,455,914,350円、決済開始日2026年7月14日、資金調達方法は金融機関からの借入」 — PALTAC完全子会社化のため、公開買付けを決議・実施（買付期間、代金、決済、資金調達）する。
- 「2026年1月、MPアグロがシグニホールディングスを取得（対価8,500百万円、取得原価8,500百万円、現金取得）」 — MPアグロがシグニホールディングスを取得（現金対価、取得原価、取引日等）。
- 「本事業年度の配当: 1株当たり66円（中間32円、期末34円）
- 当期配当総額: 6,570百万円（2025年11月5日決議）、6,959百万円（2026年5月14日決議）」 — 当期の配当（1株当たり66円、内訳、配当総額と決議日）を示す。
- 「PALTACを対象に公開買付けを実施予定（買付期間2026/5/12〜2026/7/7、買付代金192,455,914,350円、決済開始日2026/7/14、資金調達方法：金融機関からの借入）」 — PALTACに対する公開買付けの条件（買付期間・買付代金・決済開始・借入による資金調達）を示す。
- 「自己株式取得・消却: 3,251,000株を取得、3,251,000株を消却、総額7,999,832,693円」 — 自己株式の取得・消却（株数・金額）を実施する。
- 「シグニホールディングス株式会社の取得（対価8,500百万円、取得日2026年1月30日、取得 %100、将来的連結効果見込み）」 — シグニホールディングス取得の対価・取得日・取得比率等を示し、将来的効果見込みにも触れる。
- 「PALTACを完全子会社化する目的の公開買付け実施を決議（2026年5月11日取締役会）。対象株式買付期間は2026年5月12日～2026年7月7日、買付代金は192,455,914,350円、決済開始日2026年7月14日、資金調達方法は金融機関からの借入。」 — PALTAC完全子会社化の公開買付け決議と条件（期間、代金、決済開始、借入）を再掲する。
- 「5年間累計での株主還元性向: 40%」 — 中期ビジョン期間（5年間累計）で株主還元性向40%を目指す。

### 物流・デジタル/品質（ALC、AI・自動化、GDP/GxP等）

- 「物流機能の高度化・効率化を通じたコスト削減・生産性向上を重要施策とします（物流センターの拡張・統合、基幹システムの改修等を含む）。」 — 物流機能の高度化・効率化によるコスト削減・生産性向上を重要施策とする。
- 「2026年1月には東京ALCを稼働させ、14か所目のALC」 — 2026年1月に東京ALCを稼働させ、14か所目のALCとする。
- 「2026年1月には東京ALCを稼働させ、14か所目のALCを含む複合型センターの拡張を推進。」 — 東京ALC稼働を含む複合型センター拡張を推進する。
- 「デジタル基盤の強化、AI・ロボット技術の活用を通じたピッキング・物流の自動化研究開発を推進。」 — デジタル基盤強化やAI・ロボット活用によるピッキング/物流自動化の研究開発を推進する。
- 「医療用医薬品等卸売事業: メディセオのメディカル流通センター神戸・東京ALC等へ4,217百万円の設備投資、販売・物流基幹システム改修2,492百万円」 — 医療用卸売事業で、メディセオの神戸・東京ALC等への設備投資や基幹システム改修を行う。
- 「ISO9001認証を関連事業所のALC（9か所）で取得（メディスケット等）」 — 関連事業所（ALC等）でISO9001認証を取得する。
- 「ＭＰタウタクのRD C滋賀建設等2,417百万円」 — 化粧品・日用品/一般用医薬品領域で、MPタウタクのRDC滋賀建設等の投資を行う。
- 「2026年1月には東京ALCを稼働させ、14か所目のALCを含む複合型センターの拡張を推進。

- 医療用医薬品等卸売事業: メディセオのメディカル流通センター神戸・東京ALC等へ4,217百万円の設備投資、販売・物流基幹システム改修2,492百万円」 — 2026年1月に東京ALCを稼働させ、14か所目のALCを含む拡張を進める。
- 「ISO9001認証の取得（関連事業所ALC9か所における取得）」 — ISO9001認証取得（関連事業所ALC9か所等）を示す。
- 「品質管理手法（GDP/GDPガイドライン、GD P等に準拠した物流・品質管理）」 — GDPガイドライン等に準拠した品質管理（物流・品質）を行う。
- 「デジタル基盤の強化、AI・ロボット技術の活用を通じたピッキング・物流の自動化研究開発を推進。
- データ活用による販促提案・顧客ニーズの把握と、購買データ活用による効率的販売の推進。」 — デジタル基盤強化、AI・ロボット活用等によりピッキング・物流自動化研究開発を推進する。
- 「化粧品・日用品、一般用医薬品卸売事業: ＭＰタウタクのRD C滋賀建設等2,417百万円、ソフトウェア投資243百万円」 — 化粧品・日用品/一般用医薬品領域で、MPタウタクのRDC滋賀建設等とソフトウェア投資を行う。
- 「東京ALC（Area Logistics Center）等の新設・拡張を推進」 — 東京ALC等の新設・拡張を推進する。
- 「GD Pガイドラインに沿った品質管理」 — GDPガイドラインに沿った品質管理を行う。

### 研究開発・検査/ライフサイエンス領域（希少疾患・腸内環境等）

- 「J-Brain Cargo適用物質の非臨床・臨床試験を対象とした希少疾患治療薬候補物質（JCRが創製）」 — JCRが創製した希少疾患治療薬候補物質（JR-479）に関する開発・契約の位置づけを示す。
- 「JR-479（GM2ガングリオシドーシス対象、海外展開・日本での共同開発・商業化契約）」 — JR-479（GM2ガングリオシドーシス対象）の海外展開・共同開発・商業化契約を示す。
- 「LOX-index検査（動脈硬化リスク評価用比色法・腸内環境関連検査等）」 — LOX-index検査等、動脈硬化リスク評価/腸内環境関連検査の取り組みを示す。
- 「病院・自治体等を対象とした医療材料データベース・検体のマスター管理関連サービス」 — 医療材料データベースや検体のマスター管理など、病院・自治体向けサービスに言及する。
- 「J-Brain Cargo適用物質に関する実施許諾契約等（JCRとの契約に基づく）」 — JCRファーマとのJ-Brain Cargo適用物質に関する実施許諾契約等に触れる。
- 「Flora Scan検査（腸内環境測定）」 — Flora Scan検査（腸内環境測定）を実施/提供する。
- 「JCRファーマ株式会社との海外展開における実施許諾契約（ライセンス・実施許諾）」 — JCRファーマとの海外展開における実施許諾契約（ライセンス等）。
- 「研究開発投資額: 1,512百万円
- 主な重点領域: 希少疾患治療薬、腸内環境・炎症マーカー、LAB標準化材、 Flora Scan の検査精度向上」 — 研究開発費と重点領域（希少疾患、腸内環境・炎症マーカー、LAB標準化材、Flora Scan等）を示す。
- 「病院・自治体等を対象とした医療材料データベース・検体のマスター管理」 — 医療材料データベース・検体マスター管理関連サービスに言及する。

### サステナビリティ・人材・ガバナンス/リスク管理（脱炭素、D&I、配当方針、体制・規制リスク）

- 「マテリアリティ6項目（持続可能な医療流通、収益性の向上、人材育成、D&I、脱炭素、健全な経営）を設定」 — サステナビリティの重要課題（マテリアリティ）6項目を設定する。
- 「コンプライアンス統括室を社長直轄で設置」 — コンプライアンス統括室を社長直轄で設置する。
- 「サステナビリティ方針に基づき「未来へつなごう『元気と、かがやき』」の方針を公表」 — サステナビリティ方針「未来へつなごう『元気と、かがやき』」を公表する。
- 「指名・報酬委員会を設置、独立性の高い社外取締役4名を確保」 — 指名・報酬委員会の設置や、独立性の高い社外取締役の確保に触れる。
- 「脱炭素目標: 2031年3月期 Scope1+Scope2で50%削減（2021年3月期比）、2051年3月期 カーボンニュートラル」 — 脱炭素目標（2031年にScope1+Scope2で50%削減、2051年にカーボンニュートラル）を示す。
- 「IFRS16リース基準の適用開始予定日: 2028年3月期の期首
- リース会計基準の適用影響は未評価」 — IFRS16リース基準の適用開始予定日（2028年3月期期首）と、適用影響の評価未了に触れる。
- 「育児休業取得: 男性労働者の育児休業取得率 2031年3月期 100%」 — 男性労働者の育児休業取得率目標（2031年目標100%）を示す。
- 「ダイバーシティ指標: 管理的地位にある労働者に占める女性労働者の割合 2031年3月期 20%以上」 — D&I指標として、管理的地位にある労働者の女性比率（2031年目標20%以上）を示す。
- 「薬価制度の改定・薬価基準の見直しによる販売価格影響（2020年度・2022年度・2024年度の薬価改定率の公表・未公表の項目を含む）により、卸売事業の業績・財政状態へ影響の可能性。
- 医薬品医療機器等法に基づく許認可の維持・変更が業績へ影響するリスク。」 — 薬価制度/薬価基準見直し等による販売価格影響や許認可維持のリスクを示す。
- 「管理的地位にある労働者に占める女性労働者の割合 2031年3月期 20%以上」 — 管理的地位にある労働者の女性比率（2031年目標20%以上）を示す。
- 「当座貸越枠: 1,845億円」 — 当座貸越枠（1,845億円）による流動性リスク対応に触れる。
- 「薬価制度の改定・薬価基準の見直しによる販売価格影響（2020年度・2022年度・2024年度の薬価改定率の公表・未公表の項目を含む）により、卸売事業の業績・財政状態へ影響の可能性。」 — 薬価制度改定・薬価基準見直しによる販売価格影響が業績/財政状態に与える可能性を示す。
- 「気候変動リスク・自然災害による物流・供給拠点の操業影響、BCPの必要性。」 — 気候変動リスク・自然災害による物流/供給拠点への影響やBCPの必要性に触れる。
- 「取締役会・監査役会・グループ社長会・コンプライアンス・リスクマネジメント委員会等の体制を整備」 — 取締役会・監査役会・グループ社長会・コンプライアンス/リスク管理委員会等の体制整備に触れる。
- 「医薬品医療機器等法に基づく許認可の維持・変更が業績へ影響するリスク。」 — 医薬品医療機器等法に基づく許認可の維持・変更が業績へ影響するリスク。
- 「少子高齢化・人口動態の変化による市場環境の変動。物流・購買動向・需要パターンの変化が事業へ影響するリスクが存在。」 — 少子高齢化・人口動態変化に伴う市場環境変動や物流/購買動向のリスクを示す。
- 「労働力不足・物流費上昇・賃金上昇などの人件費動向が全体のコスト構造に影響。」 — 労働力不足・物流費上昇・賃金上昇などの人件費動向がコストに影響するリスクを示す。
- 「脱・単一ライン依存によるリスク分散と、バックアップ体制の強化を推進。物流DX・自動化の導入検討を継続。」 — 単一ライン依存のリスク分散やバックアップ体制、物流DX/自動化導入検討に言及する。
- 「医薬分野では、地域医療コーディネート活動、物流機能の高度化、GD Pガイドラインに沿った品質管理、薬価制度の影響への対応、取引慣行の改善などを優先課題としています。」 — 医薬分野での優先課題（地域医療コーディネート、物流高度化、GDP準拠品質管理、薬価制度対応、取引慣行改善）を示す。
- 「医薬品医療機器等法に基づく許認可の維持・変更」 — 医薬品医療機器等法に基づく許認可の維持・変更。
- 「情報セキュリティ・個人情報保護リスク等の情報資産リスク。」 — 情報セキュリティ/個人情報保護等の情報資産リスクに触れる。
- 「為替変動リスクに対するヘッジはデリバティブ取引で対応。ヘッジは主に外貨建債務・外貨建取引のキャッシュ・フローを固定化する目的。」 — 為替変動リスクに対するヘッジ方針（デリバティブでキャッシュフローを固定化する目的）。
- 「IFRS16リース基準の適用開始予定日: 2028年3月期の期首」 — IFRS16リース基準の適用開始予定日（2028年3月期期首）に触れる。
